Todas os documentos produzidos pela instituição são eletrônicos, elaborados dentro do SEI (Sistema Eletrônico de Informações). Qualquer pessoa externa à Universidade que precise assinar algum documento deverá realizar seu cadastro no SEI.
O Sistema Eletrônico de Informações - SEI, desenvolvido pelo Tribunal Regional Federal da 4ª Região - TRF4 e cedido gratuitamente para as instituições públicas, é a solução de processo eletrônico adotada pela UFU para dar cumprimento ao Decreto nº 8.539, de 8 de outubro de 2015, que estabeleceu o uso do meio eletrônico para a realização do processo administrativo no âmbito dos órgãos e das entidades da administração pública federal direta, autárquica e fundacional.